Esta área es una de las que más casos referidos aporta al Hospital. Para su atención se dispone de dos quirófanos completamente equipados que pueden funcionar de manera simultánea. Ambos disponen de avanzados equipos de anestesia y monitorización, así cómo de equipos de soporte vital avanzado. Los cirujanos veterinarios que prestan este servicio poseen una dilatada experiencia profesional, realizando periódicamente estancias de perfeccionamiento y reciclaje en centros de reconocido prestigio nacional e internacional, dentro y fuera de Europa. Javier López, miembro activo del Comité Científico del GEVO ( Grupo de Especialistas Veterinarios en Ortopedia) y postgrado por la UAB en Medicina y Cirugia Veterinaria dirige esta sección del Hospital desde su inicio. Coordina a su vez la disponibilidad permanente de un equipo de emergecias quirúrgicas que atienden los casos que se reciben fuera de horario. Se reciben pacientes referidos para cirugías de trauma, neurología, tej blandos y cirugia torácica, aplicándose en su resolución las técnicas reconocidas y contrastadas de más reciente implantación.